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基因驅(qū)動(dòng)(gene drive)研究最新進(jìn)展
時(shí)間:2017-10-16 09:29:27 來(lái)源:生物谷 點(diǎn)擊:
近年來(lái),“基因驅(qū)動(dòng)”成為生物學(xué)界的新興熱門研究領(lǐng)域之一,它指的是特定基因有偏向性地遺傳給下一代的一種自然現(xiàn)象。最近幾年發(fā)現(xiàn)的CRISPR基因編輯技術(shù)有潛力構(gòu)建、簡(jiǎn)化和改進(jìn)針對(duì)基因驅(qū)動(dòng)的開(kāi)發(fā)。借助被譽(yù)為“基因剪刀”的CRISPR基因編輯技術(shù),科學(xué)家研發(fā)出人工“基因驅(qū)動(dòng)”系統(tǒng),并在酵母、果蠅和蚊子中證實(shí)可實(shí)現(xiàn)外部引入的基因多代遺傳。

基因驅(qū)動(dòng)(gene drive),最早在2003年由倫敦帝國(guó)理工學(xué)院進(jìn)化遺傳學(xué)家Austin Burt提出,是一個(gè)能夠快速將特定性狀擴(kuò)散到群體中去的系統(tǒng)。一般來(lái)說(shuō)物種中都會(huì)存在這樣一些基因,它們?cè)诜敝车倪^(guò)程被遺傳的概率比普通基因高出50%。因此,這些基因就可以很容易在群體中散播,即使它們可能導(dǎo)致個(gè)體的適應(yīng)性下降。借由與這些特殊基因類似的遺傳“偏向性”,基因驅(qū)動(dòng)在理論上可將這些人為改造的基因散播到野生群體中。而這些改造可以包括基因的增添、破壞或者修飾,也可以包括減少個(gè)體的生育能力從而可能導(dǎo)致整個(gè)物種的毀滅。

人工改造的基因驅(qū)動(dòng)有潛力將所需的基因在野生種群(wild population)中擴(kuò)散,或者抑制有害的生物物種。因有潛力控制諸如攜帶寨卡病毒(Zika virus)、瘧原蟲和登革熱病毒的蚊子之類的有機(jī)體,它最近獲得了人們的大量關(guān)注。

基于此,小編針對(duì)基因驅(qū)動(dòng)研究取得的進(jìn)展以及引起的爭(zhēng)論,進(jìn)行一番盤點(diǎn),以饗讀者。

1.Nat Rev Genet:人工改造的基因驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)操縱野生種群命運(yùn)
doi:10.1038/nrg.2015.34

 
在一篇高度創(chuàng)新性和技術(shù)性的綜述文章,美國(guó)加州大學(xué)河濱分校昆蟲學(xué)助理教授Omar Akbari說(shuō),“盡管基因驅(qū)動(dòng)存在所有的潛在益處,它們?nèi)匀晃传@得充分研究。考慮到這一點(diǎn)以及技術(shù)進(jìn)步產(chǎn)生得如此之快,我們想退一步考慮,從一個(gè)更寬廣的角度看看到底發(fā)生了什么。”

Akbari是加州大學(xué)河濱分校病媒研究中心和整合基因組生物學(xué)研究所的一名研究員,也是這篇發(fā)表在Nature Review Genetics期刊上標(biāo)題為“Cheating evolution: engineering gene drives to manipulate the fate of wild populations”的文章的通信作者。這篇文章的其他作者還有Jackson Champer和Anna Buchman,這兩位都是與Akbari一起工作的博士后。

在這篇文章中,作者們著重關(guān)注了幾種類型的基因驅(qū)動(dòng),包括基于歸巢內(nèi)切酶的基因驅(qū)動(dòng)、性連鎖減數(shù)分裂驅(qū)動(dòng)、medea 基因驅(qū)動(dòng)和顯性不足基因驅(qū)動(dòng)。他們從不同的屬性上描述了這些基因驅(qū)動(dòng),包括擴(kuò)散速率、物種特異性、適合度代價(jià)(fitness cost)、抵抗易感性、可移除性和可逆性。

他們還討論了這些基因驅(qū)動(dòng)是否歸于修飾驅(qū)動(dòng)(modification drive)類型或抑制驅(qū)動(dòng)(suppression drive)類型,其中修飾驅(qū)動(dòng)旨在將目標(biāo)性狀在群體之間進(jìn)行擴(kuò)散,而抑制驅(qū)動(dòng)具有降低目標(biāo)物種群體的效果。

最后,作者們提出安全和監(jiān)管問(wèn)題。他們提出與基因驅(qū)動(dòng)相關(guān)的威脅,包括導(dǎo)致靶物種滅絕、擴(kuò)散到目標(biāo)地理區(qū)域之外的地方和影響另外一種物種的潛力,以及導(dǎo)致經(jīng)濟(jì)損失甚至生物恐怖主義的潛在濫用。

2.Nat Biotechnol:提出解決CRISPR基因驅(qū)動(dòng)問(wèn)題的方法
doi:10.1038/nbt.3412

在一項(xiàng)新的研究中,美國(guó)哈佛醫(yī)學(xué)院遺傳學(xué)教授George Church和哈佛醫(yī)學(xué)院生物工程師Kevin Esvelt博士領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)研究團(tuán)隊(duì)提出了利用基因驅(qū)動(dòng)開(kāi)展研究實(shí)驗(yàn)的幾個(gè)有效而又安全的保障機(jī)制并且提供首個(gè)逆轉(zhuǎn)基因驅(qū)動(dòng)擴(kuò)散導(dǎo)致的改變的方法。

他們通過(guò)讓分開(kāi)向?qū)NA和Cas9,使得它們不在同一個(gè)生物體內(nèi)共同表達(dá),或者插入一個(gè)人工序列到靶基因中,這樣基因驅(qū)動(dòng)僅在實(shí)驗(yàn)室的有機(jī)體中被激活,因此無(wú)法在野外發(fā)揮作用。

他們還在酵母中證實(shí)能夠逆轉(zhuǎn)基因驅(qū)動(dòng)給有機(jī)體群體施加的一種性狀。

3.基因驅(qū)動(dòng)技術(shù)或可被恐怖分子利用研制生物武器
新聞來(lái)源:'Gene drive': Scientists sound alarm over supercharged GM organisms which could spread in the wild and cause environmental disasters

據(jù)國(guó)外媒體報(bào)道,一種被稱為“基因驅(qū)動(dòng)”的基因技術(shù)近期引起了科學(xué)家們的擔(dān)憂。“基因驅(qū)動(dòng)”技術(shù)可以令兩只昆蟲交配時(shí)產(chǎn)生基因突變,形成的“超動(dòng)力基因”可遺傳至下一代。科學(xué)家警告稱,這一技術(shù)如果被恐怖分子利用,就可能生產(chǎn)出傳播致命疾病的“基因修正”昆蟲,從而導(dǎo)致一場(chǎng)史無(wú)前例的環(huán)境災(zāi)難。

以色列特拉維夫大學(xué)遺傳學(xué)家大衛(wèi)-古爾維茲介紹說(shuō),“基因驅(qū)動(dòng)”技術(shù)可以令兩只昆蟲交配時(shí)產(chǎn)生基因突變,而且極有可能將這種突變基因遺傳至下一代。研究人員將這一技術(shù)比作“無(wú)法停止的核鏈?zhǔn)椒磻?yīng)”,因?yàn)榛蚪?jīng)修改后遺傳至后代,而不管是否會(huì)對(duì)后代有害。

理論上來(lái)說(shuō),如果“基因驅(qū)動(dòng)”技術(shù)被合法利用,可用于消滅經(jīng)蚊子傳播的疾病,如瘧疾、黃熱病等。但是,如果被某些人惡意利用,則經(jīng)基因修改后的昆蟲可用來(lái)大規(guī)律傳播致命疾病。古爾維茲解釋說(shuō),“正如‘基因驅(qū)動(dòng)’技術(shù)可以讓蚊子不再攜帶和傳播瘧疾一樣,該技術(shù)也可以用來(lái)修改蚊子基因,讓蚊子攜帶致命細(xì)菌或病毒,并傳染給人類。”

近日,27位著名遺傳學(xué)家在《科學(xué)》雜志上發(fā)表文章呼吁,科學(xué)界應(yīng)向普通民眾澄清“基因驅(qū)動(dòng)”技術(shù)的利與弊,向人們解釋該技術(shù)可能會(huì)帶來(lái)災(zāi)難??茖W(xué)家們表示,“它們的隱患極大,可能給人類健康、農(nóng)業(yè)生產(chǎn)以及環(huán)境保護(hù)帶來(lái)全球性災(zāi)難。”

古爾維茲認(rèn)為,“基因驅(qū)動(dòng)”技術(shù)的具體使用方法應(yīng)該嚴(yán)格保密,和核武器技術(shù)一樣。但是,美國(guó)哈佛大學(xué)遺傳學(xué)家凱文-埃斯維爾特及其他26位科學(xué)家并不認(rèn)同古爾維茲的說(shuō)法,他們聲稱,完全公開(kāi)和透明是防止“基因驅(qū)動(dòng)”技術(shù)被用來(lái)制造生物武器的最佳方法??茖W(xué)家們呼吁,應(yīng)制定一系列安全規(guī)程,要保證被基因修正的物種不得逃散至野生種群中,比如開(kāi)展相關(guān)實(shí)驗(yàn)只能在沒(méi)有相關(guān)野生種群的區(qū)域進(jìn)行。

4.Science:科學(xué)家稱基因滅蟲技術(shù)前景喜人卻面臨困境
doi:10.1126/science.aad6143


如果這種方法起作用,并通過(guò)監(jiān)管和倫理審批,那么“基因驅(qū)動(dòng)”可能是一種清除攜帶瘧疾蚊蟲的新方法。這個(gè)想法聽(tīng)起來(lái)簡(jiǎn)單誘人:通過(guò)在一群動(dòng)物中間迅速散布一種基因,可以阻止其傳播疾病,或者直接殺死如農(nóng)業(yè)害蟲等物種。但美國(guó)國(guó)家科學(xué)院、工程院和醫(yī)學(xué)院(NAS)近日在華盛頓特區(qū)主辦的一次研討會(huì)上明確表示,這種概念的核心,即基因驅(qū)動(dòng)技術(shù)當(dāng)前仍然面臨各種科學(xué)和監(jiān)管上的不確定性。因此,基因驅(qū)動(dòng)技術(shù)的產(chǎn)業(yè)應(yīng)用依然“任重而道遠(yuǎn)”,英國(guó)倫敦帝國(guó)學(xué)院人類遺傳學(xué)家Austin Burt說(shuō)。

NAS組織了一個(gè)委員會(huì)評(píng)估這一技術(shù),該委員會(huì)組織了4次關(guān)于基因驅(qū)動(dòng)研究的科學(xué)、倫理和監(jiān)管信息研討會(huì),此次在華盛頓舉行的會(huì)議為其中的第二次。援救人員討論了現(xiàn)有監(jiān)管和倫理框架是否足以指導(dǎo)和管制基因驅(qū)動(dòng)技術(shù)的發(fā)展,會(huì)議報(bào)告稱,目前仍須了解更多關(guān)于基因驅(qū)動(dòng)技術(shù)的生態(tài)效應(yīng)、基因驅(qū)動(dòng)目標(biāo)的具體性以及研究人員在某個(gè)種群之間進(jìn)行基因改變的有效性。“很明顯,關(guān)于這個(gè)系統(tǒng),我們知道的是如此之少。”弗吉尼亞理工學(xué)院暨州立大學(xué)分子遺傳學(xué)家Zach Adelman說(shuō)。但Burt表示,考慮到目前基因驅(qū)動(dòng)技術(shù)仍處于早期研究階段,因此NAS有充分的時(shí)間就這個(gè)問(wèn)題理清頭緒。

5.PNAS:用于瘧蚊控制的基因驅(qū)動(dòng)
doi:10.1073/pnas.1521077112


在一項(xiàng)新的研究中,來(lái)自美國(guó)加州大學(xué)歐文分校的研究人員開(kāi)發(fā)出一種基于CRISPR/Cas9的基因驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)原型,用于對(duì)蚊子基因改造,以便抵抗瘧原蟲產(chǎn)生的耐藥性。

具體而言,他們構(gòu)建出一種基于CRISPR/Cas9的基因驅(qū)動(dòng)系統(tǒng),該系統(tǒng)能夠?qū)⒁环N抗瘧原蟲基因?qū)氲轿米又校⒓右詳U(kuò)散。在一項(xiàng)以斯氏按蚊(Anopheles stephensi)為研究對(duì)象的概念驗(yàn)證中,他們證實(shí)這種經(jīng)過(guò)改造的基因驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)能夠在蚊子中傳播一種雙重抗瘧原蟲效應(yīng)基因。這種基因靶向惡性瘧原蟲在感染階段產(chǎn)生的兩種關(guān)鍵蛋白,并且一個(gè)高度特異性的基因轉(zhuǎn)換時(shí)間中,它在雄性和雌性蚊子譜系中擴(kuò)散。

6.首次在哺乳動(dòng)物中實(shí)現(xiàn)“基因驅(qū)動(dòng)”,可用于清除物種入侵
 
一些與美國(guó)保護(hù)組織合作的科學(xué)家聲稱,他們首次成功地在哺乳動(dòng)物中建立了一種被稱作“基因驅(qū)動(dòng)”的技術(shù),并且可以利用它來(lái)消滅在島上搶奪海鳥生存空間的侵入性嚙齒動(dòng)物。

目前有分別來(lái)自澳大利亞和德克薩斯州的兩個(gè)科學(xué)團(tuán)隊(duì)表示,他們對(duì)家鼠進(jìn)行了基因編輯,使其基因組包含了野生種群的一些基因特征。這些改良的嚙齒類動(dòng)物在最近兩個(gè)月才出生,因此還未有實(shí)驗(yàn)結(jié)果。 

另外,在哺乳動(dòng)物身上建立基因驅(qū)動(dòng)模型還得益于一個(gè)“保護(hù)島嶼”行動(dòng)的支持和努力。這是一個(gè)來(lái)自加州圣克魯茲的保護(hù)組織,他們的座右銘是“防止滅絕”,并專長(zhǎng)于在島中廣撒殺鼠劑來(lái)拯救瀕危海鳥。

但是殺鼠劑不能在大型或人口稠密的島嶼上用來(lái)殺滅嚙齒類動(dòng)物,這也是基因驅(qū)動(dòng)技術(shù)被該組織看好的原因。“我們正在尋找一些真正有創(chuàng)造性的方法”,該項(xiàng)目主任卡爾·坎貝爾說(shuō)。如果當(dāng)局允許該項(xiàng)目計(jì)劃的話,每年則可撥出約700萬(wàn)美元,讓他們能夠在一個(gè)偏遠(yuǎn)的島嶼上進(jìn)行初步試驗(yàn),以加快技術(shù)開(kāi)發(fā)進(jìn)程。

7.Science:生物界“新寵”基因驅(qū)動(dòng),消除瘧疾的“利器”
doi:10.1126/science.aal0797


作為一種可以修飾DNA遺傳的方法,“基因驅(qū)動(dòng)”可以使蚊子的遺傳物質(zhì)發(fā)生改變,最后甚至導(dǎo)致其數(shù)量驟減。科學(xué)家正在使用該方法來(lái)降低瘧疾傳播率,以保護(hù)非洲兒童免受瘧疾侵襲

。 如果我們知道決定瘧蚊關(guān)鍵性特征的基因或基因變異,如與原蟲轉(zhuǎn)陰及產(chǎn)卵等特性相關(guān)的基因,從理論上來(lái)說(shuō)就可以將某些基因修改引入蚊子種群來(lái)降低瘧疾傳播率。目前,研究人員已對(duì)多個(gè)種類的瘧蚊進(jìn)行了基因組測(cè)序,包括那些幾乎造成了非洲所有地方瘧疾傳播的瘧蚊。他們希望通過(guò)基因改造整個(gè)蚊子種群來(lái)保護(hù)非洲兒童免受瘧疾侵襲。

近日,來(lái)自亞利桑那州大學(xué)(Arizona State University)的進(jìn)化生態(tài)學(xué)家詹姆斯·科林斯(James Collins)在美國(guó)科學(xué)促進(jìn)會(huì)年度會(huì)議(AAAS)上關(guān)于“基因驅(qū)動(dòng)”消除瘧疾的專訪被Science刊發(fā)。

基于基因組編輯技術(shù)CRISPR的進(jìn)步,“基因驅(qū)動(dòng)”在抗寄生蟲領(lǐng)域也得到了重要運(yùn)用。但如美國(guó)科學(xué)、工程、醫(yī)學(xué)院( National Academies of Sciences, Engineering, and Medicine )去年所言:由于對(duì)整個(gè)人口的遺傳信息的改造可能產(chǎn)生的意想不到的后果,因此其在釋放到任何環(huán)境中時(shí)都應(yīng)該采取廣泛的測(cè)試。

8.Science:防范與管理新興技術(shù)
doi:10.1126/science.aah5125


在一項(xiàng)新的研究中,美國(guó)海斯汀中心(The Hastings Center)研究學(xué)者Gregory Kaebnick作出結(jié)論,鑒于管理新興技術(shù)需要對(duì)技術(shù)的使用進(jìn)行限制,這是因?yàn)檫@些技術(shù)的潛在傷害和其他后果是高度不確定性的,在管理新興技術(shù)時(shí)采取的防范方法經(jīng)常被批評(píng)為反映“風(fēng)險(xiǎn)恐慌”,但是防范能夠與對(duì)科學(xué)的支持是相一致的。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2016年11月11日那期Science期刊上,論文標(biāo)題為“Precaution and governance of emerging technologies”。

這篇論文討論了在基因驅(qū)動(dòng)(gene drive)的情形下,采取防范方法的益處,其中基因驅(qū)動(dòng)有望解決根除蚊媒傳染病和保護(hù)瀕危物種等長(zhǎng)期存在的問(wèn)題但也會(huì)冒著傷害整個(gè)生態(tài)系統(tǒng)風(fēng)險(xiǎn)的技術(shù)。Kaebnick是美國(guó)國(guó)家科學(xué)、工程與醫(yī)學(xué)研究院(U.S. National Academies of Science, Engineering, and Medicine, NASEM)基因驅(qū)動(dòng)委員會(huì)的成員。該委員會(huì)在去年夏天發(fā)布一篇推薦采取防范方法的報(bào)告。他的論文共同作者是這個(gè)委員會(huì)的一些成員和員工。

這篇論文詳細(xì)敘述NASEM這篇報(bào)告提出的建議。不是對(duì)所有關(guān)于基因驅(qū)動(dòng)的研究采取防范方法---比如暫停所有這方面的研究直到嚴(yán)格的全球監(jiān)管措施被執(zhí)行,這篇報(bào)告號(hào)召采取“針對(duì)性的但有意義的措施”。這樣的措施會(huì)鑒定出特定的易于控制的擔(dān)憂,比如基因驅(qū)動(dòng)能夠?qū)τ袡C(jī)體的基因組產(chǎn)生不想要的影響,一種基因驅(qū)動(dòng)修飾的有機(jī)體能夠?qū)σ环N生態(tài)系統(tǒng)產(chǎn)生不想要的影響,而且對(duì)什么是“不想要的”影響可能在不同人之間差異較大。

9.Science:在實(shí)驗(yàn)室中開(kāi)展基因驅(qū)動(dòng)實(shí)驗(yàn)應(yīng)謹(jǐn)慎
doi:10.1126/science.aac7932

圖片來(lái)自Caroline Davis2010/Flickr。
 
近期,來(lái)自美國(guó)、英國(guó)和日本的研究人員探討了開(kāi)發(fā)基于CRISPR的基因驅(qū)動(dòng)系統(tǒng),并指出在實(shí)驗(yàn)室中開(kāi)展這種基因驅(qū)動(dòng)實(shí)驗(yàn)時(shí),應(yīng)當(dāng)慎之又慎。相關(guān)探討結(jié)果發(fā)表在Science期刊上,標(biāo)題為“Safeguarding gene drive experiments in the laboratory”。 

Valentino Gantz和Ethan Bier之前利用CRISPR/Cas9基因編輯系統(tǒng)的優(yōu)勢(shì),開(kāi)展基因驅(qū)動(dòng)實(shí)驗(yàn):他們開(kāi)發(fā)出一種被稱作突變鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Mutagenic Chain Reaction, MCR)的系統(tǒng)。利用MCR系統(tǒng),他們可將一種雜種突變轉(zhuǎn)化為一種純合突變。他們已在果蠅體內(nèi)證實(shí)了MCR系統(tǒng)的有效性:在97%的情形下,它可將攜帶的突變導(dǎo)入到染色體的靶位點(diǎn)上。 

雖然這些研究人員采用嚴(yán)格的屏蔽方法和額外的預(yù)防措施,但是一些科學(xué)家仍然認(rèn)為在未來(lái),在實(shí)驗(yàn)室中操縱基于CRISPR的實(shí)驗(yàn),應(yīng)當(dāng)尤為謹(jǐn)慎。

最后,這些研究人員建議,在基因組上開(kāi)展基因驅(qū)動(dòng)實(shí)驗(yàn)在實(shí)際應(yīng)用時(shí)多采用替代方法,從而降低帶來(lái)的風(fēng)險(xiǎn)。
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