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數(shù)據(jù)庫資源
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一分鐘讀懂基因檢測(cè)的是與非
時(shí)間:2015-02-11 09:45:21 來源:生物谷 點(diǎn)擊:

最近不少人問我,是否應(yīng)該進(jìn)行DNA測(cè)序。他們還問我:“你做過DNA測(cè)序嗎?”作為一名研究患者基于何種原因進(jìn)行基因測(cè)序的醫(yī)生,遇到這樣的問題不足為奇,有時(shí)我自己也想知道。

12年前,科學(xué)家首次對(duì)人類基因組進(jìn)行測(cè)序,當(dāng)時(shí)的成本約為10億美元。此后,基因測(cè)序的成本直線下滑,如今已降至約5000美元,且很快會(huì)跌至1000美元以下,使得這樣的問題變得越來越常見。與之前的檢測(cè)手段能夠提供的基因信息量相比,全基因組測(cè)序能提供數(shù)百萬倍的信息量。為此,許多患者都進(jìn)行了基因測(cè)序。

此外,美國總統(tǒng)奧巴馬在2015年國情咨文演講中還推出了“精準(zhǔn)醫(yī)療計(jì)劃”(precision medicine initiative),其中就涉及到基因組測(cè)學(xué)工程。這也會(huì)讓基因測(cè)序變成一個(gè)普通的問題。

隨著成本下滑,越來越多的人開始進(jìn)行基因測(cè)序。例如,大量癌癥患者選擇了全基因組測(cè)序,因?yàn)楦鶕?jù)基因信息能夠預(yù)測(cè)他們對(duì)各種化學(xué)療法的反應(yīng)。那些患有先天性疾病兒童的父母也迫切想知道,基因突變是否是孩子患病的罪魁禍?zhǔn)?。如果真是這樣,將來他們可以對(duì)此進(jìn)行干預(yù),以防影響第二胎。

此外,對(duì)于特定疾病患者,整個(gè)基因組測(cè)序的價(jià)格已經(jīng)接近于單個(gè)基因測(cè)序的價(jià)格,如乳腺癌。為幫助治療,醫(yī)生也在對(duì)一些嬰兒的基因組進(jìn)行測(cè)序。將來,我們之中的大多數(shù)可能都會(huì)經(jīng)歷基因測(cè)序。醫(yī)生只要在辦公室里,就能利用你面前的計(jì)算機(jī)完成DNA測(cè)序。

許多人還會(huì)主動(dòng)找到基因測(cè)序公司進(jìn)行基因測(cè)序。在過去的幾年中,許多人在23andMe這樣的基因測(cè)序公司進(jìn)行了基因測(cè)序。目前,這些基因測(cè)序公司只是檢測(cè)人類整個(gè)基因組的一小部分基因,僅占人體DNA的百萬分之一,即所謂的單核苷酸多態(tài)性(SNPs)分析。

但隨著時(shí)間的推移,這些公司將啟動(dòng)更多的SNPs測(cè)序。即便如此,也僅占人體DNA的十萬分之一。不管怎樣,這些公司表示,將提供血統(tǒng)之外更多有醫(yī)療價(jià)值的信息。SNPs所提供的信息相對(duì)有限,而整個(gè)基因組測(cè)序所能提供的信息要高出數(shù)十萬倍。

DNA分子由四種脫氧核糖核苷酸組成,分別是腺嘌呤、嘧啶、胸腺嘧啶和鳥嘌呤,英文字母縮寫分別為A、C、T和G,涵蓋30億個(gè)堿基對(duì)的序列信息。盡管如此,人與人之間的基因相似度高達(dá)99.9%。(人與黑猩猩基因相似度為98%,與?;蛳嗨贫葹?0%,與雞基因相似度為60%。)

讓我們用一個(gè)形象的例子對(duì)此進(jìn)行說明。書架上有1000冊(cè)書籍,其內(nèi)容共包含30億個(gè)字母。如果將這些字母比作DNA,那么其中999本書的信息都是相同的。只有1本書中包含的字母是不同的,并決定了我們眼睛顏色、頭發(fā)顏色、鼻子形狀,以及患某種疾病的可能性等等。

如果檢測(cè)100萬個(gè)SNPs,相當(dāng)于每3000個(gè)字母中檢測(cè)1個(gè)字母,即每頁檢測(cè)1個(gè)字母。如果看書時(shí)只看每頁的一個(gè)字母(或一個(gè)基因),那我們從中得到的信息將十分有限。

但是,進(jìn)行整個(gè)基因組測(cè)序,患者將擁有整個(gè)基因組測(cè)序信息,即閱讀全部1000冊(cè)書籍。目前,一些基因測(cè)序公司正在直接面向消費(fèi)者提供該服務(wù)。這些服務(wù)所產(chǎn)生的大量數(shù)據(jù)是極具價(jià)值的,包括用于醫(yī)療領(lǐng)域。

基因測(cè)序后,你可能會(huì)被發(fā)現(xiàn)存在一些與某種疾病相關(guān)的遺傳標(biāo)記。其實(shí),其中一部分是可以預(yù)防的,如乳腺癌。但人們習(xí)慣于認(rèn)為,發(fā)現(xiàn)一個(gè)致病基因?qū)砭鸵欢〞?huì)患病,如惡性腫瘤基因或肥胖基因。其實(shí),大部分常見病是多個(gè)基因和環(huán)境因素共同作用的結(jié)果。因此,你可能有一個(gè)基因會(huì)導(dǎo)致患某種疾病的風(fēng)險(xiǎn)提高2倍(從10%提高到30%),那么你不會(huì)患病的幾率仍高達(dá)70%。當(dāng)然,這種疾病目前可能還沒有治療方案,如阿爾茨海默?。蠢夏臧V呆癥)。因此,對(duì)患者進(jìn)行相關(guān)教育至關(guān)重要。

許多患者擔(dān)心基因歧視問題?!哆z傳信息無歧視法案》(GINA)確保了美國民眾的基因信息不被濫用和歧視。根據(jù)這部法律,如果基因檢測(cè)顯示某人可能易患某種疾病,保險(xiǎn)公司不得據(jù)此提高醫(yī)療保險(xiǎn)費(fèi)用或者拒絕為其提供保險(xiǎn),其他公司也不得把基因信息作為招聘、解雇或提拔員工的依據(jù)。雖然這部法案涵蓋了大多數(shù)醫(yī)療保險(xiǎn),但目前還沒有解決人壽、傷殘或長(zhǎng)期就醫(yī)保險(xiǎn)問題。但我相信,將來這部法案會(huì)進(jìn)一步保護(hù)這些人群。

當(dāng)然,是否進(jìn)行基因檢測(cè)不一定完全由患者來決定。當(dāng)前,一些醫(yī)生已經(jīng)開始為特定患者提供基因檢測(cè)服務(wù)。一些進(jìn)行特定疾病研究的研究人員也開始進(jìn)行整個(gè)基因組測(cè)序,試圖找出病因,給出治療方案。很顯然,我們之中的許多人將被包括在內(nèi),或者是從中受益。

因此,當(dāng)人們問我是否應(yīng)該進(jìn)行基因測(cè)序時(shí),我回答說:“你為什么要進(jìn)行基因測(cè)序呢?”一些人,尤其是對(duì)科學(xué)感興趣的人,他們通常會(huì)說“知道自己的基因信息會(huì)很酷”。有人認(rèn)為“知識(shí)就是力量”,還有人擔(dān)心自己的健康問題。如果你真想進(jìn)行基因測(cè)序,最好先咨詢一下醫(yī)生。另外,臨床遺傳學(xué)專家和遺傳咨詢顧問可能比你的醫(yī)生更了解一些具體的問題。

我也很想了解自己DNA中究竟蘊(yùn)藏著哪些信息。幸運(yùn)的是,我很健康,沒有什么重大醫(yī)學(xué)問題,因此目前還沒有進(jìn)行DNA測(cè)序的必要。當(dāng)然,將來可能會(huì)改變。

不管怎樣,無論是醫(yī)生還是患者,我們都進(jìn)入了一個(gè)美好的新世界,做任何事情都要謹(jǐn)慎。因此,我還沒有進(jìn)行DNA測(cè)試,至少目前如此。

本文作者羅伯特·克里茲曼(Robert Klitzman)是哥倫比亞大學(xué)臨床精神病學(xué)教授。

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