目前，基因測序行業(yè)正在步入蓬勃發(fā)展時期，在未來也將改變生命科學(xué)及醫(yī)療領(lǐng)域的發(fā)展軌跡。與此同時，基因大數(shù)據(jù)爆炸式的增長，對海量數(shù)據(jù)的計算、存儲和分析提出新的挑戰(zhàn)。前不久，阿里云與國內(nèi)多家基因公司開展合作，建立精準(zhǔn)醫(yī)療開放平臺，進軍基因領(lǐng)域。
12月22日，“百度-協(xié)和醫(yī)學(xué)院食管癌研究項目”在北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院舉辦簽約儀式。雙方將充分發(fā)揮北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院的醫(yī)學(xué)研究優(yōu)勢和百度大數(shù)據(jù)與人工智能等技術(shù)優(yōu)勢，發(fā)現(xiàn)與中國人密切相關(guān)的食管癌早期診斷的標(biāo)志物，為我國食管癌的早期篩查、早期診斷和藥物研發(fā)提供重要依據(jù)，為腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的實施奠定基礎(chǔ)。據(jù)悉，此次合作中，百度CEO李彥宏將個人捐贈3000萬元，支持百度與北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院針對食管癌基因組研究的合作。
百度CEO李彥宏與北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院校長曾益新院士出席發(fā)布會并見證簽約儀式, 百度副總裁梁志祥與北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院副校長，分子腫瘤學(xué)國家重點實驗室主任詹啟敏院士共同簽署合作協(xié)議。
長期以來，中國食管癌發(fā)病率高居世界首位，據(jù)估算，全球50%以上的食管癌患者都在中國。由于缺乏早期診斷的標(biāo)志物，大部分患者發(fā)現(xiàn)時已是晚期，加上缺乏有效的臨床治療藥物，患者的5年生存率僅為10%左右。另一方面，我國的食管癌患者95%以上是食管鱗癌，而歐美國家多為食管腺癌，歐美的食管癌研究對中國醫(yī)學(xué)界并無太多借鑒作用，進行食管癌全基因組的測序分析和功能研究，找出食管癌早期診斷的生物標(biāo)志和藥物靶標(biāo)迫在眉睫。
北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院校長曾益新指出：“北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院與百度此次攜手合作，將充分發(fā)揮雙方專業(yè)領(lǐng)域優(yōu)勢。此次合作對深入了解食管癌的分子機理、提高我國食管癌預(yù)警、早期診斷和預(yù)防能力具有重要的科學(xué)和現(xiàn)實意義。”
互聯(lián)網(wǎng)企業(yè)首次牽手醫(yī)學(xué)科研機構(gòu)開展癌癥研究
據(jù)了解，百度與北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院的此次合作將是國內(nèi)互聯(lián)網(wǎng)企業(yè)與國家級醫(yī)學(xué)科研機構(gòu)在癌癥研究領(lǐng)域的首次深度合作。
在此次合作發(fā)起前，雙方相互看中了各自領(lǐng)域里的優(yōu)勢。“協(xié)和醫(yī)學(xué)院是中國最好的醫(yī)學(xué)研究單位，百度則有很多數(shù)據(jù)，有很強的計算能力?？梢韵嗷ソY(jié)合找到癌癥并發(fā)的原因。百度也希望成為中國最有情懷的大數(shù)據(jù)公司。”李彥宏表示，“這次合作是互聯(lián)網(wǎng)技術(shù)與生命科學(xué)的一次聯(lián)手，是大數(shù)據(jù)、人工智能技術(shù)應(yīng)用于醫(yī)學(xué)研究的一次嘗試。相信這樣的組合，不管是對中國的生命科學(xué)研究、還是對人工智能等互聯(lián)網(wǎng)技術(shù)應(yīng)用領(lǐng)域的拓展，都是一次非常有價值的探索。我們相信科學(xué)技術(shù)的發(fā)展最終將造福人類。”
“基因測序產(chǎn)生的數(shù)據(jù)需要大量的存儲空間,測序后的處理和分析需要強大的計算資源,這些能力正是百度所擅長的。進一步講,百度在分布式計算方法與算法上有深厚的積累,會有助于測序后結(jié)果的比對等分析的效率與效果，”百度研究院副院長張潼告訴記者，百度將為大規(guī)模生物信息的存儲提供幫助，大數(shù)據(jù)與人工智能等技術(shù)的引入，能夠加速生物信息的相關(guān)計算，為更精準(zhǔn)有效地對食管癌基因變異進行對比提供了可能。
全球最大樣本量的癌癥基因測序分析
據(jù)介紹，該項目在實施層面由北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院分子腫瘤學(xué)國家重點實驗室承擔(dān)。按照計劃，此次合作項目將于2016年初啟動，在兩年時間內(nèi)完成1500例食管癌患者的組織樣本收集，100個食管癌家系血液樣本的收集，并將在2017年年前完成整個項目的測序和生物分析工作。“腫瘤基因測序基本上幾百例樣本就算是比較大的了，上千例是沒有的，”北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院分子腫瘤學(xué)國家重點實驗室副主任劉芝華教授表示，此次合作研究將對1500位食管癌患者進行全基因組測序分析，在世界范圍內(nèi)，如此大規(guī)模的基因測序分析亦為首次。
