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專家觀點(diǎn)
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天士力胡曉芳:基因測(cè)序的下一個(gè)應(yīng)用爆發(fā)點(diǎn)在哪里?
時(shí)間:2015-06-24 09:37:46 來(lái)源:生物探索 點(diǎn)擊:

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2015年6月4日,來(lái)自天士力國(guó)際創(chuàng)新投資事業(yè)部的胡曉芳博士在2015國(guó)際體外診斷高峰論壇上作了“基于醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)的診療一體化趨勢(shì)”的演講。

首先,她表示,全部人類基因組約有2.91Gbp(base pair,堿基對(duì)),約有39000多個(gè)基因。人類遺傳密碼的破譯啟動(dòng)了醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)之旅,2014年Illumina宣布其新產(chǎn)品HiSeqXTen可以實(shí)現(xiàn)人類單基因組測(cè)序成本下降到1000美元以下,基因測(cè)序技術(shù)成本的下降催熟了臨床應(yīng)用。

無(wú)創(chuàng)產(chǎn)檢是基因測(cè)序的第一個(gè)殺手級(jí)應(yīng)用

2015年1月16日,國(guó)家衛(wèi)計(jì)委發(fā)布了第一批無(wú)創(chuàng)基因檢測(cè)108家試點(diǎn)醫(yī)療機(jī)構(gòu)的名單,全球無(wú)常產(chǎn)檢市場(chǎng)迅速成長(zhǎng),中國(guó)無(wú)創(chuàng)產(chǎn)檢將創(chuàng)造出100億左右的市場(chǎng)。

基因測(cè)序的下一個(gè)應(yīng)用爆發(fā)點(diǎn)在哪里?

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胡曉芳博士表示,23andMe自2006年成立以來(lái), 以99塊美金低價(jià)推出個(gè)人全基因檢測(cè),主要面向大眾消費(fèi)者滿足好奇心和自我探索,其商業(yè)模式尚在積累,且測(cè)序不是問(wèn)題,瓶頸是解讀能力。

Foundation Medicine(NASQ:FMI)自2009年成立后在短短3年內(nèi)就推出檢測(cè)產(chǎn)品,至2014年底已收集檢測(cè)的35,000個(gè)臨床腫瘤樣品,并進(jìn)行了大量癌癥相關(guān)基因的測(cè)序,突變數(shù)據(jù)分析,臨床信息、藥物信息關(guān)聯(lián)研究,形成大數(shù)據(jù)庫(kù);根據(jù)檢測(cè)和分析結(jié)果,給病人提供個(gè)性化治療方案并收集療效信息。

隨著檢測(cè)樣本的增加和指導(dǎo)用藥數(shù)據(jù)的積累,提供的治療方案會(huì)越來(lái)越精準(zhǔn),也就是說(shuō)大數(shù)據(jù)的積累會(huì)從量變引起質(zhì)變,數(shù)據(jù)具備進(jìn)化性,走向精準(zhǔn)治療,她認(rèn)為以二代基因測(cè)序技術(shù)為基礎(chǔ)面向臨床醫(yī)生指導(dǎo)腫瘤精準(zhǔn)用藥的FMI商業(yè)模式逐漸成熟。此外,羅氏與FMI合作投入超過(guò)1.5億美金用于研發(fā)——在基因測(cè)序指導(dǎo)藥物研發(fā)占得先機(jī)!

以腫瘤診療為例,基因測(cè)序和大數(shù)據(jù)分析帶來(lái)的市場(chǎng)機(jī)會(huì)

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在演講過(guò)程中,胡博士還表示,以腫瘤診療為例,通過(guò)分析基因測(cè)序和大數(shù)據(jù)分析帶來(lái)了巨大的市場(chǎng)機(jī)會(huì):以基因測(cè)序引導(dǎo)的腫瘤風(fēng)險(xiǎn)管理將形成萬(wàn)億級(jí)別的腫瘤預(yù)防市場(chǎng);協(xié)助醫(yī)生對(duì)患者進(jìn)行精準(zhǔn)診斷將形成百億級(jí)別的精確診斷市場(chǎng);以標(biāo)志物驅(qū)動(dòng)的新藥研發(fā)將形成千億級(jí)別的精準(zhǔn)藥物開發(fā)市場(chǎng)。

基因測(cè)序是癌癥個(gè)性化治療的基礎(chǔ),細(xì)胞癌變是由基因突變驅(qū)動(dòng)的,驅(qū)動(dòng)突變(Driver Mutation)的不斷累積最終導(dǎo)致細(xì)胞癌變?;诨驕y(cè)序的“藥物-伴隨診斷”正受到全球制藥界越來(lái)越多的重視。

液體活檢——血液循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)的巨大應(yīng)用價(jià)值

由于ctDNA技術(shù)日趨成熟(CAPP-Seq),今年4月15日,羅氏宣布收購(gòu)在2013年由斯坦福大學(xué)的腫瘤學(xué)家和行業(yè)老兵成立的基因組學(xué)研發(fā)公司——CAPP Medical,后者專注于利用NGS開發(fā)通過(guò)檢測(cè)血液中的循環(huán)腫瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)進(jìn)行癌癥篩查和監(jiān)測(cè)的技術(shù)。

血液循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)腫瘤可應(yīng)用于早期診斷、轉(zhuǎn)移復(fù)發(fā)監(jiān)測(cè)、治療效果檢測(cè)(耐藥檢測(cè))等方面。

腫瘤預(yù)防——腫瘤易感基因篩查和健康管理

2013年5月好萊塢明星安吉麗娜· 朱莉(Angelina Jolie)自曝已經(jīng)接受了預(yù)防性乳房切除術(shù),以降低罹癌風(fēng)險(xiǎn)。而真正的原因是由于朱莉母親給她遺傳了突變的BRCA1基因,因此患乳腺癌和卵巢癌的幾率都比較高,分別是87%和50%。

根據(jù)美國(guó)NCCN 醫(yī)學(xué)指南對(duì)乳腺癌早期篩查的建議,中國(guó)婦女發(fā)展基金會(huì)和女性腫瘤預(yù)防基金發(fā)起和領(lǐng)導(dǎo)了最大規(guī)模的乳腺癌流行病學(xué)調(diào)查,建立中國(guó)預(yù)防乳腺癌模型金標(biāo)準(zhǔn),腫瘤預(yù)防和體檢市場(chǎng)正在迅速成長(zhǎng)。

精準(zhǔn)藥物開發(fā)——基于大數(shù)據(jù)分析的、biomarker驅(qū)動(dòng)的藥物開發(fā)

不同組織類型的腫瘤有同樣Biomarker,可參與同一個(gè)試驗(yàn)藥物的臨床試驗(yàn);不同組織類型的腫瘤病人,按照不同的Biomarker,分在不同的試驗(yàn)藥物組,可以是不同的臨床階段。通過(guò)基因測(cè)序以及挖掘已有基因信息來(lái)確定疾病的驅(qū)動(dòng)基因的信息,確定癌癥發(fā)生發(fā)展的具體靶點(diǎn),通過(guò)驅(qū)動(dòng)基因突變定義治療腫瘤和治療人群。

更大場(chǎng)景的醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)支持的診療一體化趨勢(shì)

在演講的最后,胡博士表示:我們正處在最好的時(shí)代,不久的將來(lái),大數(shù)據(jù)分析的應(yīng)用將會(huì)快速,廣泛的涌現(xiàn)在整個(gè)醫(yī)療保健機(jī)構(gòu)和醫(yī)療保健行業(yè)。通過(guò)醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)的深入分析,有效促進(jìn)治療方案的快速進(jìn)化。

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