DNA測(cè)序新突破將造福萬千媽咪
時(shí)間：2014-03-14 09:21:47 來源：生物探索 點(diǎn)擊：
DNA測(cè)序已經(jīng)以一種戲劇性的全新方式進(jìn)入了醫(yī)療界：在早早孕時(shí)期檢測(cè)染色體缺陷。25年來，我們知道，胎兒的DNA痕跡可以通過懷孕母親的血液來進(jìn)行檢測(cè)，然而這些痕跡非常之小，而且到目前為止，我們尚沒有技術(shù)來檢測(cè)到DNA正常的多余染色體。
上周，在《新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志》（The New England Journal of Medicine）上發(fā)表的一篇研究文章中，戴安娜?碧昂琪（Diana Bianchi）和她的同事們向我們展示了，DNA測(cè)序如何能以驚人的準(zhǔn)確率幫助檢測(cè)到多余的染色體。這篇報(bào)告開啟了胎兒DNA檢測(cè)的新時(shí)代。首先讓我們來了解一些背景知識(shí)：人體的第21對(duì)染色體多出一條變成三條就會(huì)引起唐氏綜合征（Down syndrome），這種遺傳學(xué)疾病導(dǎo)致智力缺陷和生長(zhǎng)遲緩。唐氏綜合征也被稱為“21-三體綜合征”，“三體”即染色體變成三條而不是正常的兩條。更為少見的愛德華茲綜合征（Edwards syndrome）則由人體第18對(duì)染色體的三體變異導(dǎo)致，故而又稱“18-三體綜合征”，其后果要嚴(yán)重得多，大部分妊娠會(huì)中途發(fā)生終止。而其他染色體的三體變異也通常會(huì)導(dǎo)致早產(chǎn)或流產(chǎn)。出于多種原因，準(zhǔn)爸媽們都想要知道胎兒是否攜帶這種不正常的變異因素。
上述新檢測(cè)法的精確率令人印象深刻。在1,914名健康的年輕懷孕婦女中，僅有8人的胎兒染色體出現(xiàn)多余，而這一測(cè)試方法將全部8例都檢測(cè)了出來。最令人印象深刻的是其較低的假陽性率：總體而言，這一新DNA檢測(cè)法僅報(bào)告9例假陽性（21-三體變異或18-三體變異），而傳統(tǒng)的篩查測(cè)試盡管也發(fā)現(xiàn)了全部的8例真陽性案例，其假陽性結(jié)果卻高達(dá)80例，幾乎是DNA測(cè)序法的9倍之多。
為何這一方法如此重要？在大部分情況下，得到陽性結(jié)果的女性會(huì)選擇羊膜穿刺術(shù)，這是一種侵入性檢查，醫(yī)生會(huì)用一根長(zhǎng)針直接穿入子宮，采集一些羊水樣本。一般情況下，羊膜穿刺術(shù)能對(duì)唐氏綜合征做出一個(gè)確定的鑒定。采用傳統(tǒng)方法的假陽性率非常之高，羊膜穿刺術(shù)可推翻95%以上的假陽性結(jié)論，而新的DNA測(cè)序法的這一比例則僅為55%?；蛘哂帽贪虹鞯热说脑拋碚f：
“如果所有得到陽性結(jié)果的女性選擇進(jìn)行入侵性檢查，那么診斷性入侵性檢查的數(shù)量將減少89%。”懷孕婦女及其伴侶剪影。
懷孕婦女及其伴侶剪影
入侵性檢查的數(shù)量減少89%，這可是一個(gè)巨大的幅度，不僅僅意味著成本的降低，也意味著父母壓力和胎兒風(fēng)險(xiǎn)的減少（羊膜穿刺術(shù)可能會(huì)引起流產(chǎn)）。
DNA測(cè)序法每一年都在變得速度更快、費(fèi)用更便宜，所以，現(xiàn)在看到這種方法僅被用于檢測(cè)三染色體細(xì)胞，不免令我們有些吃驚。
檢測(cè)多余染色體的困難之處在于，DNA基因序列本身是正常的。如果你對(duì)基因進(jìn)行測(cè)序，你不會(huì)發(fā)現(xiàn)任何顯示胎兒擁有多余染色體的變異。而這就是下一代基因測(cè)序技術(shù)驚人效率起作用的地方。
現(xiàn)代測(cè)序儀器能在短短幾小時(shí)時(shí)間內(nèi)對(duì)數(shù)百萬DNA小碎片進(jìn)行采樣。我們可以使用計(jì)算機(jī)分析法來確定哪些碎片來自于胎兒，以及哪些碎片來自于每條染色體。
如果任何染色體出現(xiàn)了三條，那么該條染色體DNA增加的幾率上升了50%?；驕y(cè)序的力量來自于其以大量數(shù)據(jù)為依托：因?yàn)槲覀兛梢詫?duì)每條染色體的許多碎片進(jìn)行測(cè)序，那么50%的上升幾率就會(huì)較為容易地被檢測(cè)到。
碧昂琪所采用的檢測(cè)三體變異的方法是2011年艾米?賽奈特（AmyAehnert）及其同事的研究成果，其中一些人也是上述新研究報(bào)告的參與者（注：他們使用的是一種名為Bowtie的軟件項(xiàng)目來進(jìn)行分析，該軟件由我的學(xué)生本?蘭米德[BenLangmead]開發(fā)）。這一方法將隨著時(shí)間的推移而變得更好：進(jìn)一步降低假陽性率。
美國(guó)婦產(chǎn)科醫(yī)師協(xié)會(huì)（American College of Obstetricians and Gynecologists）早已建議有胎兒染色體異常（多余染色體）風(fēng)險(xiǎn)的孕婦采用DNA檢測(cè)。確切來說，他們建議高風(fēng)險(xiǎn)孕婦在獲得遺傳學(xué)咨詢之后，擁有做胎兒DNA檢測(cè)的選擇權(quán)。上述研究是在低風(fēng)險(xiǎn)孕婦人群中進(jìn)行的，其表明，產(chǎn)前DNA測(cè)試的益處應(yīng)該讓所有女性都有權(quán)利享受到。
