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專家觀點
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全基因組測序對你有什么用?
時間:2014-01-03 10:09:17 來源:生物探索 點擊:

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如果你跟我媽一樣,一點遺傳學知識都沒有,就想知道全基因組測序對你有什么用,我可以先給你講講紫薇的故事。

美國NIH幾年前開展了一項臨床試驗(ClinSeq),目的就是探討將全基因組測序應用于臨床的模式。我有幸作為遺傳咨詢師參與其中一段時間。我們招募健康成年人,向他們提供全基因組測序前后的遺傳咨詢,看他們對測序結果的理解程度如何,以及追蹤測序結果對他們心理,生活方式和醫(yī)療選擇的影響。下面介紹的內容都來自于我跟受試者的遺傳咨詢,除了紫薇的部分。。

全基因組測序測神馬?

我現(xiàn)在覺得皇阿瑪說紫薇是一本深不可測的書是非常有道理的。紫薇如果是本英文書,里面的一個章節(jié)就是一條染色體,每個章節(jié)里面的段落就是基因,每個段落里的英文字母就是遺傳密碼。為了讀懂紫薇這個人,皇阿瑪其實可以找機器把這些字母都掃描一遍。你就發(fā)現(xiàn)紫薇這本書長這樣:

 

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你如果拿你和紫薇做比較,你會發(fā)現(xiàn)你們大部分的段落都是一樣的,為什么那?因為你們都是人。比如,紫薇的第三章第一自然段說她應該有兩條腿,你的第三章第一自然段應該和她是一樣的,因為你也有兩條腿。但你可能發(fā)現(xiàn)在有些地方,她是A你是T,這點差別叫做變異(variant)。也許一個自然段只有一兩處變異,整本書算下來可能有上百萬的變異,這些變異造就了你是你,紫薇是紫薇。

每個人都與眾不同。全基因組測序就是拿你的書和正規(guī)教材比(就是根據(jù)一大堆沒啥大毛病的健康人群編寫的),看你的變異有哪些。變異有很多種,測序都能測出來。但是,你有能力吃成一個大胖子,不代表你應該吃成一個大胖子;雖然測序技術有能力把你所有的變異都找出來,不代表所有的變異你都應該知道。

哪些變異應該讓你知道?什么時候讓你知道?誰有做決定的權利?你知道了對你有好處嗎?有什么壞處嗎?怎樣保證你能理解這些變異?做決定的時候必須要考慮哪些因素?一說到這些問題我就激動了。這些問題各種專家和領導應該考慮(好像有人在笑),你也要考慮,因為歸根結底是你測序?;拾斂床欢限?,你也別指望有誰能比你更了解自己。

測序的結果有哪些?對你有什么意義?

請看大屏幕:

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1. 注意,大部分的變異是良性的,它們和疾病都沒有關系。這些變異只是讓我們每個人都與眾不同。比如紫薇雙眼皮你單眼皮,紫薇高鼻梁你塌鼻梁等等。

2. 只有一小部分的變異跟疾病的發(fā)生有關系。

(1) 有些變異會解釋你的疾病史。比如,你有高血壓,我們可能會找到這些疾病的致病基因。這樣的結果對你來說也許在意料之中,也沒有什么大用。因為就算你不做測序,你也知道你有高血壓,家里其他人也知道他們患高血壓的風險會增加。而且你該怎么治病還是怎么治病。

(2) 有些變異會給你提供預警。你患某種病的風險可能比其他人高。比如,你有BRCA1/2基因突變,你患乳腺癌卵巢癌的風險比其他人高很多,你的生活方式需要有所改變,你癌癥早期篩查的策略也會跟其他人不一樣。但是,如果發(fā)現(xiàn)你有老年癡呆癥的基因變異,你的發(fā)病率會比正常人高,發(fā)病時間也會提前,可惜現(xiàn)在沒有任何預防或者治療方式。

(3) 有些變異顯示你是某種隱性遺傳病基因突變的攜帶者。也就是說,你自己沒有任何癥狀,但如果你的另一半也是攜帶者,你們的后代患病的風險就會增加。比如地中海貧血。

3. 還有一些變異目前我們知道的信息有限,不知道它是良性的還是跟某種疾病相關的。也許將來的某一天我們會知道。

以上任何一種情況都有可能。如果你現(xiàn)在要決定做測序,你想知道所有跟疾病相關的變異嗎?還是只有其中一種?如果情況是3,你愿意收到更新嗎?比如,你已經50歲了,你的孩子都很健康,你也不打算要小孩了,你還愿意收到跟某種異性遺傳病相關變異的信息更新嗎?

你的遺傳咨詢師或者醫(yī)生可以幫助你理解這些信息,但最終得到哪些信息,選擇權在你。

備注:本文作者為關悅,美國遺傳咨詢協(xié)會認證遺傳咨詢師,畢業(yè)于約翰霍普金斯大學/美國國家人類基因組研究中心。

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