人巨細(xì)胞病毒蛋白質(zhì)組測序完成
時間：2012-11-26 13:23:37 來源：三濟(jì)生物 點(diǎn)擊：
來自：生物無憂
美國和德國研究人員進(jìn)行的一項(xiàng)新研究增加了我們對人巨細(xì)胞病毒(HCMV)以及它對所感染寄主細(xì)胞的操縱機(jī)制的理解。
HCMV是一種非常常見的皰疹病毒,它的感染率為50-100%,其感染后通常不會產(chǎn)生疾病表征,并可能會潛伏多年。HCMV感染在發(fā)展中國家比在發(fā)達(dá)國家更常見.該病毒可以導(dǎo)致新生嬰兒先天畸型,并給免疫力低下的患者帶來嚴(yán)重的甚至致命的影響。另外,還有研究顯示該病毒可能在癌癥的發(fā)展過程中發(fā)揮一定作用。
美國舊金山加利福尼亞大學(xué)Jonathan Weissman實(shí)驗(yàn)室的Noam Stern-Ginossar領(lǐng)導(dǎo)了這一研究,來自美國和德國的研究人員組成的團(tuán)隊(duì)觀察了這一病毒的蛋白組,即調(diào)查了所有表達(dá)的蛋白.研究人員認(rèn)為,基因組編碼的潛在蛋白質(zhì)圖譜很多是基于計(jì)算機(jī)模型的預(yù)測,這是很不完全的。
在20年前,HCMV的基因組被首次測序成功,之后又有另外16種病毒株被測序。HCMV是一個特別大的病毒基因組,大約有240000個堿基對。
該研究小組對人類成纖維細(xì)胞被HCMV感染后的細(xì)胞核糖體位置進(jìn)行了蛋白質(zhì)圖譜的測定。核糖體是細(xì)胞內(nèi)負(fù)責(zé)蛋白生產(chǎn)的細(xì)胞器。之后,研究人員用質(zhì)譜的方法確定了這些預(yù)測蛋白是否存在。這一研究確定了之前尚未確定的編碼于基因組中的上百種蛋白。
編碼蛋白的DNA片段被稱為“開放閱讀框”。之前的研究根據(jù)HCMV基因組的序列,已經(jīng)預(yù)測出了大約200種可能存在的閱讀框.在這一新研究中,研究小組發(fā)現(xiàn)了在預(yù)測閱讀框中的一些編碼極短蛋白序列（由100個甚至更少的氨基酸組成）的開放閱讀框。他們還發(fā)現(xiàn),一些開放閱讀框是位于另一些閱讀框內(nèi)部的。這一蛋白組的復(fù)雜性令他們非常驚訝和意外。
解病毒基因組表達(dá)的蛋白質(zhì)情況能夠幫助我們確定這些病毒是如何影響寄主細(xì)胞的,并幫助我們找出抑制它們感染寄主細(xì)胞的方法。
這篇文章發(fā)表在Science雜志上,研究小組提到:他們所用到的核糖體基因組圖譜以及質(zhì)譜分析相結(jié)合的方法還可以用于確定其它復(fù)雜的病毒蛋白組。
美國和德國研究人員進(jìn)行的一項(xiàng)新研究增加了我們對人巨細(xì)胞病毒(HCMV)以及它對所感染寄主細(xì)胞的操縱機(jī)制的理解。
HCMV是一種非常常見的皰疹病毒,它的感染率為50-100%,其感染后通常不會產(chǎn)生疾病表征,并可能會潛伏多年。HCMV感染在發(fā)展中國家比在發(fā)達(dá)國家更常見.該病毒可以導(dǎo)致新生嬰兒先天畸型,并給免疫力低下的患者帶來嚴(yán)重的甚至致命的影響。另外,還有研究顯示該病毒可能在癌癥的發(fā)展過程中發(fā)揮一定作用。
美國舊金山加利福尼亞大學(xué)Jonathan Weissman實(shí)驗(yàn)室的Noam Stern-Ginossar領(lǐng)導(dǎo)了這一研究,來自美國和德國的研究人員組成的團(tuán)隊(duì)觀察了這一病毒的蛋白組,即調(diào)查了所有表達(dá)的蛋白.研究人員認(rèn)為,基因組編碼的潛在蛋白質(zhì)圖譜很多是基于計(jì)算機(jī)模型的預(yù)測,這是很不完全的。
在20年前,HCMV的基因組被首次測序成功,之后又有另外16種病毒株被測序。HCMV是一個特別大的病毒基因組,大約有240000個堿基對。
該研究小組對人類成纖維細(xì)胞被HCMV感染后的細(xì)胞核糖體位置進(jìn)行了蛋白質(zhì)圖譜的測定。核糖體是細(xì)胞內(nèi)負(fù)責(zé)蛋白生產(chǎn)的細(xì)胞器。之后,研究人員用質(zhì)譜的方法確定了這些預(yù)測蛋白是否存在。這一研究確定了之前尚未確定的編碼于基因組中的上百種蛋白。
編碼蛋白的DNA片段被稱為“開放閱讀框”。之前的研究根據(jù)HCMV基因組的序列,已經(jīng)預(yù)測出了大約200種可能存在的閱讀框.在這一新研究中,研究小組發(fā)現(xiàn)了在預(yù)測閱讀框中的一些編碼極短蛋白序列（由100個甚至更少的氨基酸組成）的開放閱讀框。他們還發(fā)現(xiàn),一些開放閱讀框是位于另一些閱讀框內(nèi)部的。這一蛋白組的復(fù)雜性令他們非常驚訝和意外。
解病毒基因組表達(dá)的蛋白質(zhì)情況能夠幫助我們確定這些病毒是如何影響寄主細(xì)胞的,并幫助我們找出抑制它們感染寄主細(xì)胞的方法。
這篇文章發(fā)表在Science雜志上,研究小組提到:他們所用到的核糖體基因組圖譜以及質(zhì)譜分析相結(jié)合的方法還可以用于確定其它復(fù)雜的病毒蛋白組。
